「放課後は白銀の調べ」はMAP選択式のアドベンチャーゲームです。
プロローグ以降は、一日に二回（午前・午後）行動（場所）選択を行う事によって話を進めていきます。

午前のフェイズでは、任意の場所に式神である「久遠」を派遣することにより、他のクラスの授業風景を眺めたり、昼間の校内の様子を探ったりできます。
（選択場所や行動内容によっては、要自身が行動することもあります）

午後のフェイズでは、要自らが移動して「放課後調査」を行います。
部活に参加するも良し、退魔師としての仕事に励んでも良し――
もちろん、気になるキャラクターを追いかけるのも良いでしょう。
意外な接点が見つかるかもしれません。

放課後調査時や物語の進行により、魔との戦闘に入ることがあります。
出現する魔は各々属性を持っており、祓った魔の属性によって「久遠」の属性値が変化します。
（PS2版同様、この戦闘は自動で行われます）

「木・火・土・金・水」全ての属性値が一定の値に達すると、久遠が成長します。 久遠の成長は式神調査に影響し、能力が高いほど「より詳しく」周囲の様子を見ることができます。
最初の内は聞き取れなかった囁き声の内容がはっきりと判るようになったり――キャラクターの心の声を捉えることもあるでしょう。

久遠のレベルは次の周回に持ち越されます。